¿Qué es OMOP?
El OMOP Common Data Model (CDM) es un estándar internacional desarrollado por la comunidad OHDSI (Observational Health Data Sciences and Informatics) que permite unificar, armonizar y analizar datos clínicos procedentes de distintas fuentes (hospitales, EHR, laboratorios, registros administrativos, claims, etc.) utilizando una estructura común y un vocabulario terminológico estandarizado.
Gracias a OMOP:
- Los datos se transforman a un formato común interoperable, independiente del sistema de origen.
- Es posible comparar y combinar datos entre instituciones y países.
- Se facilita la realización de investigación observacional de alta calidad, análisis de seguridad, estudios de vida real (RWE), farmacovigilancia y proyectos multicéntricos.
- Las herramientas del ecosistema OHDSI (ATLAS, Achilles, DQD, Usagi, etc.) permiten cohorte building, analítica avanzada y evaluación de calidad de forma estandarizada.
En resumen: OMOP convierte datos heterogéneos en un lenguaje común para obtener evidencia clínica reproducible, transparente y escalable.
Servicios de RHS en OMOP & Data Harmonization
En RHS ayudamos a instituciones sanitarias, universidades, CROs y proyectos europeos a transformar sus datos clínicos en OMOP, garantizando calidad, reproducibilidad y cumplimiento normativo.
✔ 1. Evaluación y diagnóstico inicial (Data Readiness Assessment)
- Análisis técnico del sistema de origen (EHR, LIS, HIS, AP-Madrid, SELENE, SERVER, SAP, etc.).
- Identificación de tablas, campos y procesos relevantes.
- Recomendaciones sobre gobernanza, calidad de datos y arquitectura óptima.
✔ 2. Diseño de la estrategia ETL (Extract–Transform–Load)
- Diseño del flujo completo de transformación OMOP.
- Definición del mapeo entre sistemas locales y el CDM.
- Selección de vocabularios estándar (SNOMED, LOINC, RxNorm, ATC, ICD…).
- Documentación formal según buenas prácticas OHDSI (Rabbit-in-a-Hat).
✔ 3. Terminología y estandarización semántica
- Mapeo automático y manual con Usagi.
- Curación de códigos locales y validación experta.
- Gestión de actualizaciones terminológicas.
✔ 4. Implementación completa del ETL a OMOP
- Desarrollo reproducible en Python, SQL o herramientas específicas.
- Despliegue en servidores locales, VPS, cloud privado o entorno del cliente.
- Carga incremental o por lotes según necesidades del proyecto.
✔ 5. Validación de calidad y auditoría
- Ejecución de Achilles y DataQualityDashboard (DQD).
- Informes detallados de calidad, completitud y consistencia.
- Revisión experta de resultados y propuestas de mejora.
✔ 6. Analítica OMOP & construcción de cohortes
- Configuración completa de ATLAS.
- Creación de cohortes reproducibles y exportables.
- Desarrollo de análisis observacionales y estudios RWE.
✔ 7. Dashboards y reporting
- Cuadros de mando en Power BI, Tableau o Metabase sobre el CDM.
- Informes clínicos, epidemiológicos y de calidad de datos.
- Entregables listos para reguladores, consorcios europeos o comités científicos.
✔ 8. Formación y soporte especializado
- Formación personalizada para equipos clínicos, técnicos y de investigación.
- Capacitación en OMOP, OHDSI, ETL, ATLAS, Usagi y DQD.
- Soporte continuo y acompañamiento en proyectos multicéntricos.
¿Por qué elegir RHS?
- Especialistas en salud digital y datos clínicos con experiencia real en hospitales y proyectos europeos.
- Implementaciones OMOP end-to-end: desde la extracción hasta dashboards y análisis.
- Enfoque coste-eficiente, evitando dependencias y dejando al cliente capacidad interna.
- Soluciones desplegables en cualquier infraestructura (on-premise, cloud privado, VPS).
- Alineados con estándares internacionales y buenas prácticas OHDSI/EMA/FDA.