¿Qué es OMOP?

El OMOP Common Data Model (CDM) es un estándar internacional desarrollado por la comunidad OHDSI (Observational Health Data Sciences and Informatics) que permite unificar, armonizar y analizar datos clínicos procedentes de distintas fuentes (hospitales, EHR, laboratorios, registros administrativos, claims, etc.) utilizando una estructura común y un vocabulario terminológico estandarizado.

Gracias a OMOP:

  • Los datos se transforman a un formato común interoperable, independiente del sistema de origen.
  • Es posible comparar y combinar datos entre instituciones y países.
  • Se facilita la realización de investigación observacional de alta calidad, análisis de seguridad, estudios de vida real (RWE), farmacovigilancia y proyectos multicéntricos.
  • Las herramientas del ecosistema OHDSI (ATLAS, Achilles, DQD, Usagi, etc.) permiten cohorte building, analítica avanzada y evaluación de calidad de forma estandarizada.

En resumen: OMOP convierte datos heterogéneos en un lenguaje común para obtener evidencia clínica reproducible, transparente y escalable.

Servicios de RHS en OMOP & Data Harmonization

En RHS ayudamos a instituciones sanitarias, universidades, CROs y proyectos europeos a transformar sus datos clínicos en OMOP, garantizando calidad, reproducibilidad y cumplimiento normativo.

1. Evaluación y diagnóstico inicial (Data Readiness Assessment)

  • Análisis técnico del sistema de origen (EHR, LIS, HIS, AP-Madrid, SELENE, SERVER, SAP, etc.).
  • Identificación de tablas, campos y procesos relevantes.
  • Recomendaciones sobre gobernanza, calidad de datos y arquitectura óptima.

2. Diseño de la estrategia ETL (Extract–Transform–Load)

  • Diseño del flujo completo de transformación OMOP.
  • Definición del mapeo entre sistemas locales y el CDM.
  • Selección de vocabularios estándar (SNOMED, LOINC, RxNorm, ATC, ICD…).
  • Documentación formal según buenas prácticas OHDSI (Rabbit-in-a-Hat).

3. Terminología y estandarización semántica

  • Mapeo automático y manual con Usagi.
  • Curación de códigos locales y validación experta.
  • Gestión de actualizaciones terminológicas.

4. Implementación completa del ETL a OMOP

  • Desarrollo reproducible en Python, SQL o herramientas específicas.
  • Despliegue en servidores locales, VPS, cloud privado o entorno del cliente.
  • Carga incremental o por lotes según necesidades del proyecto.

5. Validación de calidad y auditoría

  • Ejecución de Achilles y DataQualityDashboard (DQD).
  • Informes detallados de calidad, completitud y consistencia.
  • Revisión experta de resultados y propuestas de mejora.

6. Analítica OMOP & construcción de cohortes

  • Configuración completa de ATLAS.
  • Creación de cohortes reproducibles y exportables.
  • Desarrollo de análisis observacionales y estudios RWE.

7. Dashboards y reporting

  • Cuadros de mando en Power BI, Tableau o Metabase sobre el CDM.
  • Informes clínicos, epidemiológicos y de calidad de datos.
  • Entregables listos para reguladores, consorcios europeos o comités científicos.

8. Formación y soporte especializado

  • Formación personalizada para equipos clínicos, técnicos y de investigación.
  • Capacitación en OMOP, OHDSI, ETL, ATLAS, Usagi y DQD.
  • Soporte continuo y acompañamiento en proyectos multicéntricos.

¿Por qué elegir RHS?

  • Especialistas en salud digital y datos clínicos con experiencia real en hospitales y proyectos europeos.
  • Implementaciones OMOP end-to-end: desde la extracción hasta dashboards y análisis.
  • Enfoque coste-eficiente, evitando dependencias y dejando al cliente capacidad interna.
  • Soluciones desplegables en cualquier infraestructura (on-premise, cloud privado, VPS).
  • Alineados con estándares internacionales y buenas prácticas OHDSI/EMA/FDA.